More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4216 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30 
 
 		 266 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  36.75 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 634 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  32.67 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08181  hypothetical protein  34.71 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.82 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.82 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.4 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.71 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10526  RmtA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5VLE3]  33.58 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.614609  normal  0.0936655 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.09 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  28.21 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.18 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.09 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.09 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.09 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  31.64 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  31.64 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.63 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  31.64 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  31.64 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  31.64 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  31.47 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  31.07 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.23 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.35 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  34.58 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  34.78 
 
 		 580 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.04 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  35.24 
 
 		 776 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  24.5 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5061  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  35.16 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  27.63 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  36.08 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  32.71 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.96 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.04 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  34.26 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.13 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.38 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.78 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.52 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.78 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30.77 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  28.36 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>