102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3952 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  63.64 
 
 		 299 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  63.64 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  63.64 
 
 		 334 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  64.64 
 
 		 298 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  59.71 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  44.29 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  44.92 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  42.91 
 
 		 288 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  44.53 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  47.08 
 
 		 318 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  47.6 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  46.69 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  46.69 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  46.69 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  46.69 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  46.69 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  46.69 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  44.53 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  47.98 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  45.59 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  43.06 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  44.75 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  44.53 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  44.92 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  44.14 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  40.48 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  42.35 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  42.7 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  44.83 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  41.99 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  41.99 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  44.35 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  44.27 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  41.2 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  41.2 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  44 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  41.31 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  43.31 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  40.86 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  42.92 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  38.28 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  41.04 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  49.72 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  43.81 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  37.55 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  37.4 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  40.93 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  37.54 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  41.94 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  43.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  35.25 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  37.65 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  39.62 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  39.07 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  38.73 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  35.42 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  33.76 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  31.11 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  36.36 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  34.56 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  30.2 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  36.07 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  34.47 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  31.84 
 
 		 336 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  29.03 
 
 		 347 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  27.87 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  27.87 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  27.87 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  31.07 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  30.04 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  36.36 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  30.23 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  35.95 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  34.29 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  28.23 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  28.23 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  28.11 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  32.68 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  33.33 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  29.03 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  29.13 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  35.85 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  34.59 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  26.01 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  28.51 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  30.56 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  30.77 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  27.45 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  30 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0043  Protein of unknown function DUF2236  27.21 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  24.59 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  34.26 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  25.63 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1533  Protein of unknown function DUF2236  29.52 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  30.1 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>