138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6880 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  620  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  52.24 
 
 
326 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  37.4 
 
 
267 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  36.02 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  33.73 
 
 
257 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  34.14 
 
 
268 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  34.2 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  32.76 
 
 
261 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  35.16 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  27.24 
 
 
276 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 
292 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  33.74 
 
 
281 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  32.34 
 
 
310 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  29.32 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  30.13 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  32.93 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  33.59 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  31.67 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  28.82 
 
 
300 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  33.77 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  34.42 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  28.52 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  35.9 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  31.27 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  30.68 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  33.77 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  33.77 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  27.82 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  33.12 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  32.54 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  33.12 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  33.15 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  31.82 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  29.91 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  33.77 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  33.77 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  35.06 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  33.77 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  33.77 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  26.39 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  33.77 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  33.77 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  33.77 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  32.47 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  33.77 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  33.77 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  32.93 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  34.62 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  33.56 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  33.12 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  29.79 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  32.21 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  26.67 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  26.67 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  31.82 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  29.3 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  31.82 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  27.08 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  27.94 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  27.94 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  27.94 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  32.03 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  26.3 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  27.55 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  30.87 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  31.61 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  31.61 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  31.61 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  27.91 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  28.99 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  25.18 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  30.56 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  32.68 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  25.19 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  30.97 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  27 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  28.99 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  28.99 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  29.41 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  29.11 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  26.61 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  31.13 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  27.97 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  29.53 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  26.45 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  31.61 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  30.97 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  27.31 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  27.06 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  27.54 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  30.97 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  25.63 
 
 
302 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  26.71 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  32.92 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  29.94 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  25.38 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  24.49 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  25.56 
 
 
351 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>