130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5301 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 
285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  50.8 
 
 
281 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  45.49 
 
 
261 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  37.4 
 
 
292 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  36.16 
 
 
276 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  40.89 
 
 
257 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  37.29 
 
 
268 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  32.16 
 
 
304 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  34.7 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  32.11 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  32.67 
 
 
302 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  37.32 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  33.61 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  38.28 
 
 
301 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  30.45 
 
 
303 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  30.45 
 
 
303 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  30.45 
 
 
303 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  30.56 
 
 
306 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  28.82 
 
 
342 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  32 
 
 
315 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  32.93 
 
 
312 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  28 
 
 
285 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  30.89 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  30.08 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  26.81 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  32.81 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  31 
 
 
272 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  34.7 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  31.15 
 
 
300 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  28.57 
 
 
277 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  28.79 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  30.09 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  30.09 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  30.09 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  27.93 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  29.29 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  28.85 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  27.48 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  28.31 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  29.26 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  29.91 
 
 
351 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  24.33 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  24.33 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  24.91 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  23.4 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  28.81 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10481  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00162641  normal  0.337442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  26.46 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  26.46 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  26.46 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  32.89 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  27.83 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  23.42 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  33.57 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  33.57 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  33.57 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  31.51 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  28.06 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  30.32 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  25.83 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  32.29 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  24.59 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  31.72 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  26.42 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  23.61 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  32.14 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  26.41 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  32.34 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  26.47 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  26.47 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  31.84 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  31.84 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  26.73 
 
 
303 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  34.06 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  30.21 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  30.11 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  30.65 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  30.05 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  27.59 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  27.59 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  43.82 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  29.41 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  27.59 
 
 
334 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  25.94 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  30.85 
 
 
317 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  31.4 
 
 
309 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  30.26 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  29.85 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  29.85 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  29.17 
 
 
288 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  30.6 
 
 
289 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  30.35 
 
 
314 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>