139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0552 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  621  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  56.38 
 
 
303 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  59.49 
 
 
303 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  59.49 
 
 
303 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  57.82 
 
 
309 aa  323  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  57.3 
 
 
302 aa  319  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  44.44 
 
 
312 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  46.18 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  46.1 
 
 
334 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  46.1 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  46.1 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  42.41 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  40.2 
 
 
339 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  41.1 
 
 
339 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  40.07 
 
 
340 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  40.22 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  40.22 
 
 
351 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  40.22 
 
 
351 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  39.85 
 
 
351 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  39.48 
 
 
355 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  38.59 
 
 
364 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  35.56 
 
 
294 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  29.35 
 
 
339 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1533  Protein of unknown function DUF2236  34.22 
 
 
223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0043  Protein of unknown function DUF2236  30.08 
 
 
263 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  30.83 
 
 
307 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  30.77 
 
 
334 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  29.45 
 
 
294 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  29.45 
 
 
294 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  29.45 
 
 
294 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  28.52 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  29.85 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  32.42 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  32.67 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  27.82 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  35.09 
 
 
322 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  31.11 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  36.49 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  29.57 
 
 
317 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  30.7 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  29.18 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  32.17 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  29.18 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  32.18 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  31.1 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  27.27 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  36.36 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  31.35 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  28.83 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  28.23 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  28.23 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  30.05 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  28.35 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  30.29 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  29.17 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  28.4 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  29.83 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  28.23 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  27.24 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  29.66 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  29.53 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  29.53 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  30.46 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  28.51 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  27.49 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  27.49 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  27.82 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  27.6 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  27.49 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  27.73 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  29.53 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  27.73 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  29.53 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  29.53 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  29.53 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  31.25 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  30.47 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  28.81 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  29.41 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  26.36 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  27.15 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  32.21 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  25.67 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  28.4 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  29.57 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  28.83 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  28.99 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  30.65 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  28.93 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  27.09 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  25 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  26.07 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  28.4 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  32.47 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  29.71 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0434  hypothetical protein  27.76 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  27.2 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  26.34 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>