116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3347 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  92.33 
 
 
313 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  73.75 
 
 
318 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  73.42 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  73.42 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  73.09 
 
 
318 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  73.09 
 
 
318 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  73.09 
 
 
318 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  73.09 
 
 
318 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  75.54 
 
 
296 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  72.58 
 
 
320 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  72.13 
 
 
314 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  72.04 
 
 
317 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  70.45 
 
 
317 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  72.04 
 
 
314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  70.97 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  70.97 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  60 
 
 
288 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  60.21 
 
 
288 aa  345  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  57.75 
 
 
288 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  63.67 
 
 
310 aa  341  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  58.6 
 
 
289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  57.89 
 
 
289 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  57.89 
 
 
289 aa  334  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  61.23 
 
 
298 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  61.23 
 
 
298 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  57.54 
 
 
293 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  57.54 
 
 
289 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  57.54 
 
 
293 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  60.52 
 
 
303 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  59.06 
 
 
298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  54.86 
 
 
290 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  60.84 
 
 
279 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  43.12 
 
 
286 aa  235  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  45.99 
 
 
309 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  43.11 
 
 
322 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  47.8 
 
 
285 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  38.18 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  40.07 
 
 
298 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  40.49 
 
 
299 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  44.83 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  39.6 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  36.39 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  38.87 
 
 
334 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  38.87 
 
 
299 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  42.17 
 
 
288 aa  162  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  42.44 
 
 
335 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  40.27 
 
 
303 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  41.36 
 
 
305 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  39.7 
 
 
282 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  34.4 
 
 
299 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  36.8 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  37.11 
 
 
298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  37.92 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  43.35 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  36.4 
 
 
302 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  36.61 
 
 
296 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  39.07 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  33.92 
 
 
306 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  32.89 
 
 
279 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  27.41 
 
 
330 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  27.41 
 
 
330 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  27.41 
 
 
330 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  43.62 
 
 
256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  30.77 
 
 
347 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  28.62 
 
 
336 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  34.83 
 
 
326 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  27.61 
 
 
332 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  31.74 
 
 
281 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  27.57 
 
 
364 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  29.02 
 
 
325 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  32.17 
 
 
272 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  32.72 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  33.77 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  27.39 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  29.68 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  30.14 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  36.41 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  30.29 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  27.56 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  28.16 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  28.71 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  29.41 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  31.03 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  28.04 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  28.04 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  28.81 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  29.55 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  29.55 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  29.55 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  28.23 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  27.43 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  27.43 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  27.31 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  31.32 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  28 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  26.53 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  28.49 
 
 
276 aa  62.4  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>