110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4913 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  607  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  37.76 
 
 
293 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  39.66 
 
 
288 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  37.41 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  37.07 
 
 
293 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  37.07 
 
 
318 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  37.07 
 
 
318 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  37.07 
 
 
318 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  37.07 
 
 
318 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  37.07 
 
 
318 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  37.07 
 
 
318 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  37.15 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  38.13 
 
 
320 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  37.46 
 
 
289 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  37.11 
 
 
289 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  37.2 
 
 
288 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  37.46 
 
 
289 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  37.46 
 
 
289 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  36.39 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  37.32 
 
 
322 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  38.91 
 
 
296 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  34.83 
 
 
314 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  39.6 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  34.26 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  39.06 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  39.06 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  35.27 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  34.55 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  34.55 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  34.55 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  38.33 
 
 
303 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  34.38 
 
 
290 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  38.67 
 
 
298 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  36.8 
 
 
279 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  37.55 
 
 
310 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  34.21 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  37.4 
 
 
289 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  31.44 
 
 
330 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  31.44 
 
 
330 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  31.44 
 
 
330 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  31.21 
 
 
364 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  31.4 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  28.57 
 
 
336 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  31.09 
 
 
305 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  31.4 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  31.74 
 
 
286 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  38.51 
 
 
285 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  34.07 
 
 
299 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  34.16 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  28.92 
 
 
299 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  28.92 
 
 
299 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  28.92 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  33.84 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  34.63 
 
 
303 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  32.03 
 
 
335 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  37.36 
 
 
311 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  33.59 
 
 
298 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  29 
 
 
299 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  31.72 
 
 
347 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  30.37 
 
 
297 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  30.53 
 
 
290 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  31.22 
 
 
302 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  31.52 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  25.57 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  27.59 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  28.79 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  30.57 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  29.52 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  28.65 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  32.39 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  28.16 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  27.37 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  26.71 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  26.06 
 
 
377 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  29.94 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  27.43 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  26.37 
 
 
355 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  28.5 
 
 
281 aa  59.3  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  25.99 
 
 
340 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  25.93 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  26.77 
 
 
301 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  24.44 
 
 
364 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  25.51 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  22.65 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  24.72 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  24.24 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  24.58 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  24.59 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  24.58 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  24.59 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  24.59 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  29.41 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  27.33 
 
 
285 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  26.09 
 
 
257 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  25.75 
 
 
339 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  25.15 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  24.37 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  33.08 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  25.11 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  26.54 
 
 
307 aa  49.3  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>