98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2947 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  756    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  29.96 
 
 
310 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  32.97 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  38.78 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  32.34 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  29.94 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  27.39 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  31.11 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  31.46 
 
 
290 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  31.11 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  29.78 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  27.17 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  31.49 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  29.05 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  31.49 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  31.11 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  32.54 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  36.3 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  31.98 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  28.4 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  31.11 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  30.56 
 
 
293 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  28.4 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  36.55 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  28.02 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  29.28 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  30.39 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  26.11 
 
 
276 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  27.24 
 
 
317 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  35.66 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  29.63 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  31.11 
 
 
288 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  32.88 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  29.44 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  30 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  28.89 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  29.67 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  28.18 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  28.18 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  27.81 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  32.61 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  25.43 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  27.44 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  32.41 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  27.27 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  29.25 
 
 
261 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  31.33 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  26.06 
 
 
298 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  29.31 
 
 
281 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  25.18 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  33.91 
 
 
285 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  25.5 
 
 
309 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  28.4 
 
 
256 aa  60.1  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  29.38 
 
 
298 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  26.42 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  26.42 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  29.49 
 
 
267 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  26.42 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  28.4 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  32.39 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  32.39 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  32.39 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  31.79 
 
 
298 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  28.12 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  26.79 
 
 
279 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  34.11 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  31.51 
 
 
289 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  26.9 
 
 
302 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  23.83 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  25.87 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  27.75 
 
 
304 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  25.44 
 
 
281 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  29.27 
 
 
272 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  32.03 
 
 
288 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  27.44 
 
 
285 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  27.62 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  25.69 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  26.97 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  23.17 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  23.89 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  23.17 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  23.17 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  23.76 
 
 
311 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  23.76 
 
 
311 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  23.78 
 
 
355 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  26.84 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  30 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  23.78 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  24.84 
 
 
364 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  25.69 
 
 
257 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>