112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4155 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  83.8 
 
 		 298 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  65.95 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  62.63 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  62.28 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  62.28 
 
 		 318 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  62.28 
 
 		 318 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  62.28 
 
 		 318 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  62.28 
 
 		 318 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  62.28 
 
 		 318 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  62.11 
 
 		 313 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  61.25 
 
 		 314 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  64.04 
 
 		 279 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  61.4 
 
 		 313 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  61.19 
 
 		 317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  60.21 
 
 		 317 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  62.32 
 
 		 296 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  61.37 
 
 		 314 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  61.01 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  61.01 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  62.32 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  56.84 
 
 		 288 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  58.04 
 
 		 289 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  56.84 
 
 		 288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  56.51 
 
 		 293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  56.64 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  56.29 
 
 		 289 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  56.29 
 
 		 289 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  55.14 
 
 		 293 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  55.4 
 
 		 288 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  55.76 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  52.46 
 
 		 290 aa  278  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  44.7 
 
 		 322 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  48.13 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  41.05 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  52.36 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  40.96 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  39.06 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  40.16 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  36.09 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  39.04 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  38.49 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  39.04 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  39.04 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  40.94 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  41.91 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  39.69 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  39.91 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  37.74 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  37.82 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  38.76 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  37.7 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  36.73 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  35.44 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  32.62 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  42.54 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  31.95 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  35.5 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  32.66 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  35.48 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  28.57 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  28.57 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  29.15 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  31.34 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  35.06 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  30.41 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  29.33 
 
 		 325 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  28.69 
 
 		 336 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  35.21 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  27.11 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  30.63 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  30.85 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  32.13 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  28.23 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  32.96 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  28.65 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  28.18 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  31.82 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  30.22 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  30.65 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  28.31 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  30.2 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  28.09 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  28.49 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  28.14 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  32.97 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  29.38 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  29.38 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  29.38 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  32.93 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  28.49 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  27.71 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  25.73 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  27.71 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  28.33 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  25.73 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  27.68 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  30.19 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  25.73 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>