102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0614 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  47.3 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  46.62 
 
 
293 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  43.62 
 
 
313 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  34.4 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  35.87 
 
 
313 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  43.71 
 
 
288 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  35.04 
 
 
335 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  33.78 
 
 
303 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  41.22 
 
 
288 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  36.7 
 
 
303 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  37.5 
 
 
320 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  40.82 
 
 
285 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  35.06 
 
 
288 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  35.06 
 
 
298 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  35.06 
 
 
298 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  36.2 
 
 
290 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  34.56 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  34.7 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  36.32 
 
 
314 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  34.05 
 
 
289 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  36.32 
 
 
314 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  36.32 
 
 
317 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  33.87 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  41.22 
 
 
318 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  33.48 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  33.48 
 
 
289 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  43.7 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  36.24 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  41.22 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  36.27 
 
 
309 aa  95.5  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  40.54 
 
 
318 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  41.72 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  40.54 
 
 
318 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  40.54 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  32.4 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  36.32 
 
 
317 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  36.32 
 
 
317 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  36.77 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  40.54 
 
 
318 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  40.54 
 
 
318 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  40.54 
 
 
318 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  40.54 
 
 
318 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  39.55 
 
 
288 aa  92.4  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  45.54 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  33.08 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  39.74 
 
 
322 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  37.67 
 
 
334 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  37.67 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  37.67 
 
 
299 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  36.54 
 
 
306 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  30.57 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  40.69 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  38.69 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  38.36 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  38.67 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  36.72 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  32.61 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  30.04 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  31.28 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  26.53 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  28.99 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  27.54 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  27.54 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  27.54 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  35.26 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  30 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  27.12 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  31.58 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  27.81 
 
 
298 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  28.4 
 
 
377 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  26.27 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  30.43 
 
 
276 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  26.61 
 
 
325 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  29.63 
 
 
268 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  29.14 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  34.45 
 
 
297 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  29.53 
 
 
305 aa  55.8  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  34 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  37.27 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  32.72 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  27.16 
 
 
300 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  31.67 
 
 
257 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  27.1 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  27.61 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  29.63 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  30 
 
 
281 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  24.9 
 
 
299 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  33 
 
 
292 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  27.78 
 
 
304 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  26.53 
 
 
311 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  26.53 
 
 
311 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  26.53 
 
 
334 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  27.52 
 
 
355 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  25.69 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  25.66 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  28.71 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  25.69 
 
 
340 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  25.69 
 
 
351 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  25.69 
 
 
351 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>