116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0614 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  92.33 
 
 
313 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  74.92 
 
 
318 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  74.59 
 
 
318 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  74.59 
 
 
318 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  74.26 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  74.26 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  74.26 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  74.26 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  73.58 
 
 
320 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  76.62 
 
 
296 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  72.47 
 
 
314 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  72.4 
 
 
317 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  72.4 
 
 
314 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  70.73 
 
 
317 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  70.61 
 
 
317 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  70.61 
 
 
317 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  59.3 
 
 
288 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  60.92 
 
 
288 aa  346  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  63.31 
 
 
310 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  56.69 
 
 
288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  61.96 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  61.96 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  58.6 
 
 
289 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  57.89 
 
 
289 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  58.25 
 
 
293 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  57.89 
 
 
289 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  60.51 
 
 
298 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  58.8 
 
 
293 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  57.39 
 
 
289 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  61.6 
 
 
279 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  59.41 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  53.82 
 
 
290 aa  311  9e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  43.48 
 
 
286 aa  239  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  45.79 
 
 
309 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  44.06 
 
 
322 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  43.35 
 
 
285 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  38.52 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  39.72 
 
 
298 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  45.59 
 
 
289 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  39.46 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  38.23 
 
 
334 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  38.23 
 
 
299 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  39.6 
 
 
298 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  38.49 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  42.57 
 
 
288 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  41.18 
 
 
335 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  40.98 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  34.4 
 
 
299 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  38.5 
 
 
303 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  38.66 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  36.72 
 
 
298 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  36.09 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  39.55 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  43.35 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  37.05 
 
 
296 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  36.21 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  33.62 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  37.67 
 
 
287 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  33.48 
 
 
306 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  35.87 
 
 
256 aa  106  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  30.36 
 
 
347 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  27.95 
 
 
330 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  27.95 
 
 
330 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  27.95 
 
 
330 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  28.28 
 
 
336 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  30.67 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  33.83 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  31.3 
 
 
281 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  27.42 
 
 
364 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  26.26 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  31.74 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  32.18 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  29.33 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  27.17 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  31.82 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  29.53 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  27.31 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  29.22 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  28.23 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  27.35 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  31.95 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  31.69 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  28.21 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  28.94 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  28.94 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  30.46 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  28.98 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  28.98 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  27.43 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  28.98 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  27.43 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  27.31 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  29.57 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  28.11 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  26.67 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  29.5 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  32.05 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  29.29 
 
 
340 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  27.27 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>