113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8395 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  67.81 
 
 
303 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  54.55 
 
 
335 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  50 
 
 
290 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  43.9 
 
 
296 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  50 
 
 
282 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  47.41 
 
 
281 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  45.34 
 
 
302 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  41.84 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  41.78 
 
 
317 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  41.78 
 
 
317 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  41.78 
 
 
317 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  41.78 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  42.22 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  41.78 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  41.33 
 
 
318 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  41.33 
 
 
296 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  41.33 
 
 
318 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  41.33 
 
 
318 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  41.33 
 
 
318 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  41.33 
 
 
318 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  41.33 
 
 
318 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  41.36 
 
 
313 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  39.32 
 
 
290 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  41.33 
 
 
314 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  41.33 
 
 
314 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  41.07 
 
 
293 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  40 
 
 
289 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  39.76 
 
 
288 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  40 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  40.97 
 
 
288 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  39.24 
 
 
310 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  40 
 
 
289 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  39.56 
 
 
289 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  39.67 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  39.24 
 
 
298 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  39.24 
 
 
298 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  38.39 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  39.15 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  37.19 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  39.55 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  41.44 
 
 
322 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  40.27 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  41.76 
 
 
298 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  40.09 
 
 
299 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  37.79 
 
 
309 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  39.23 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  39.23 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  39.23 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  40.57 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  33.84 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  39.07 
 
 
289 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  35.62 
 
 
298 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  31.7 
 
 
286 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  38.51 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  33.87 
 
 
256 aa  98.2  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  32.49 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  32.57 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  32.99 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  34.81 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  36.65 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  33.91 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  34.71 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  30.05 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  26.64 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  28.33 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  33.55 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  27.16 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  30.77 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  28.09 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  27.44 
 
 
377 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  26.74 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  32.39 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  32.14 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  27.06 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  26.01 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  31.68 
 
 
320 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  25.68 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  26.82 
 
 
364 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  30.04 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  27.65 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  27.81 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  27.04 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  25.7 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  24.86 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  24.86 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  24.86 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  23.2 
 
 
351 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  31.28 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  30.56 
 
 
339 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  26.82 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  29.45 
 
 
351 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  28.48 
 
 
334 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  27.27 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  23.9 
 
 
355 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  25.93 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  27.68 
 
 
339 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  25.93 
 
 
311 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>