90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2494 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 339 aa  698    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  54.45 
 
 		 294 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  54.45 
 
 		 294 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  54.45 
 
 		 294 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  51.84 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  52.51 
 
 		 320 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  49.64 
 
 		 334 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  35.59 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  29.62 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  30.67 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  30.46 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  31.84 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  31.84 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  29.96 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  29.89 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  28.03 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0434  hypothetical protein  25.81 
 
 		 287 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  29.58 
 
 		 307 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  25.29 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  26.28 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  26.28 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  26.28 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  24.91 
 
 		 340 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  26.75 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  23.79 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  26.99 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  26.99 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  25.64 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  26.55 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  25.79 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  27.7 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  27.07 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  23.66 
 
 		 257 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0745  hypothetical protein  25.63 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0759  hypothetical protein  25.63 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363352  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0739  hypothetical protein  25.63 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845921  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5273  hypothetical protein  21.76 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  28.38 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  24.75 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  24.71 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0968  hypothetical protein  22.98 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  27.32 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  22.4 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  26.27 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  24.71 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  24.59 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  28.42 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  23.68 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  22.46 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  30.56 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  24.6 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  25.33 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  22.85 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  22.13 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  23.2 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  23.2 
 
 		 301 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  23.32 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  26.52 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  23.89 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  23.79 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  21.84 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  23.79 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  25.53 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  32.46 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  22.39 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  22.39 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  22.39 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  24.73 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  24.39 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  29.57 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  24.5 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  24.5 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  24.5 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0043  Protein of unknown function DUF2236  21.48 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  23.29 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  27.78 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  20.46 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  24 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  24 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  22.87 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  24 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  24 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  25.5 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  24.86 
 
 		 289 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  26.54 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  26.43 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>