48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0968 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0968  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5273  hypothetical protein  82.61 
 
 
322 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0739  hypothetical protein  77.74 
 
 
318 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845921  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0745  hypothetical protein  78.06 
 
 
318 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0759  hypothetical protein  78.06 
 
 
318 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363352  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  28.47 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  28.18 
 
 
320 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  26.09 
 
 
294 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  23.41 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  27.08 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  27.59 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  27.27 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  27.27 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  27.27 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  23.68 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  30.26 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  26.19 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  22.93 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  25.74 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  23.31 
 
 
351 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  27.1 
 
 
334 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  27.1 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  27.1 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  24.15 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  26.18 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  27.23 
 
 
351 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  27.48 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  30.65 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  25.86 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  26.75 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  26.75 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  27.88 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  25.81 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  28.12 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  28.14 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  23.65 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  21.64 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  28.57 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  27.94 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  28.66 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  30.98 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  26.94 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  26.94 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  26.94 
 
 
318 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>