145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0824 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  49.63 
 
 
285 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  43.17 
 
 
276 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  48.89 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  43.14 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  37.12 
 
 
292 aa  176  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  45.49 
 
 
257 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  41.67 
 
 
290 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  37.2 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  38.75 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  33.46 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  34.62 
 
 
303 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  34.62 
 
 
303 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  34.62 
 
 
303 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  30.43 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  33.59 
 
 
272 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  33.74 
 
 
312 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  36.44 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  34.8 
 
 
298 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  30.31 
 
 
285 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  34.14 
 
 
267 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  30.83 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  37.7 
 
 
301 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  34.33 
 
 
272 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  28.57 
 
 
342 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  29.36 
 
 
304 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  31.82 
 
 
271 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  32.4 
 
 
300 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  30.8 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  30.83 
 
 
302 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  30.97 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  30.13 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  31.12 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10481  conserved hypothetical protein  26.62 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00162641  normal  0.337442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  28.14 
 
 
321 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  28.14 
 
 
343 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  28.14 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  31.48 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  29.46 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  36.27 
 
 
279 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  37.67 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  33.2 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  36.18 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  35.56 
 
 
310 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  28.83 
 
 
339 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  34.01 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  35.84 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  35.84 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  34.01 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  34.01 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  30 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  34.86 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  34.01 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  34.48 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  34.01 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  34.01 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  34.01 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  35.47 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  30.64 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  30.64 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  28.15 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  26.16 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  34.51 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  39.29 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  31.65 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  32.39 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  34.11 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  35.75 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  26.94 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  32.63 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  32.52 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  32.7 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  30.8 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  34.96 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  29.01 
 
 
351 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  32.07 
 
 
290 aa  79  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  34.96 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  30.8 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  30.8 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  31.84 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  26 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  26 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  26 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  32.75 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  27.55 
 
 
334 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  32.99 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  32.07 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  28.07 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  28.07 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  28.07 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  27.36 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  27.36 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  27.36 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  26.37 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  30.56 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  24.8 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  33.68 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  33.51 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  33.51 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>