131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3751 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  52.08 
 
 
312 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  36.8 
 
 
267 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  37.02 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  37.5 
 
 
272 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  34.16 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  30.77 
 
 
281 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  33.16 
 
 
276 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  34.83 
 
 
313 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 
292 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  37.21 
 
 
310 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  36.44 
 
 
281 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  33.47 
 
 
293 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  31.67 
 
 
261 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  35.66 
 
 
268 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  32.16 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  33.83 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  29.18 
 
 
304 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  32.92 
 
 
279 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  34.75 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  35.2 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  35.29 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  31.7 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  32.94 
 
 
347 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  34.78 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  29.12 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  34.64 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  34.64 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  34.83 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  34.83 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  34.64 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  34.64 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  34.64 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  34.64 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  32.99 
 
 
298 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  28.24 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  33.15 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  35.03 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  36.24 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  40.25 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  35.03 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  34.08 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  34.46 
 
 
320 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  32.84 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  35.48 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  29.5 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  28.63 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  28.63 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  28.63 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  30.85 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  30.85 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  34.21 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  30.85 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  34.39 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  35.06 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  32.43 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  30.36 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  27.17 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  31.98 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  32.61 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  31.84 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  32.43 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  33.12 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  32.6 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  35.95 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  35.1 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  28.8 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  28.1 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  28.38 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  30.06 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  28.05 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  29.24 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  26.69 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  29.8 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  31.54 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  26.69 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  26.69 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  34.62 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  31.07 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  26.53 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  28.33 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  27.27 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  31.25 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  31.82 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  31.82 
 
 
289 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  27.27 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  27.23 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  25.82 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  27.23 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  25.82 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  29.03 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  25.81 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  26.14 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  32.26 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  26.9 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  29.73 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  25.27 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>