113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4702 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  97.23 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  97.23 
 
 		 289 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  91.7 
 
 		 289 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  75.69 
 
 		 288 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  72.57 
 
 		 288 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  68.06 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  67.71 
 
 		 293 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  67.13 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  65.16 
 
 		 290 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  63.57 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  60.84 
 
 		 314 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  58.6 
 
 		 313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  60.71 
 
 		 314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  58.6 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  60.07 
 
 		 320 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  60 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  57.29 
 
 		 318 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  58.39 
 
 		 317 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  56.94 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  56.94 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  56.94 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  56.94 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  56.94 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  56.94 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  57.86 
 
 		 317 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  57.86 
 
 		 317 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  57.09 
 
 		 296 aa  318  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  56.47 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  56.47 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  53.76 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  57.42 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  53.6 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  47.94 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  44.06 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  44.1 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  38.97 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  46.28 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  44.14 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  37.46 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  42.62 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  42.62 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  42.62 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  41.49 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  38.91 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  41.64 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  42.27 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  38.63 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  40 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  40.81 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  39.38 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  33.95 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  30.97 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  43.68 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  34.62 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  36.61 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  35.74 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  36.73 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  34.2 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  36 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  32.05 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  29.13 
 
 		 332 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  34.05 
 
 		 256 aa  99  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  29.18 
 
 		 347 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  30.68 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  31.61 
 
 		 330 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  31.61 
 
 		 330 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  31.61 
 
 		 330 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  32.12 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  26.86 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  31.8 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  30.65 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  30.67 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  31.72 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  30.51 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  28.89 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  31.85 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  29.66 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  29.52 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  29.6 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  28.64 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  26.07 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  26.07 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  28.46 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  34.53 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  29.92 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  32.13 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  25.89 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  27.97 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  30.18 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  31.58 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  27.05 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  27.87 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  31.29 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  28.99 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  28.99 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  28.99 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>