131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1266 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 364 aa  755    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  53.67 
 
 		 351 aa  361  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  54.33 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  57.89 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  57.89 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  52.8 
 
 		 339 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  53.54 
 
 		 339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  43.83 
 
 		 351 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  43.52 
 
 		 351 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  43.52 
 
 		 351 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  45.9 
 
 		 340 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  41.99 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  44.22 
 
 		 351 aa  246  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  44.61 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  40.07 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  35.44 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  38.29 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  38.29 
 
 		 303 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  38.29 
 
 		 303 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  38.02 
 
 		 302 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  37.13 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  32.81 
 
 		 294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  29.85 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  32.16 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  27.06 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  27.06 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  27.06 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  33.68 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1533  Protein of unknown function DUF2236  29.47 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  31.94 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0043  Protein of unknown function DUF2236  32.7 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  31.72 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  30.48 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  31.72 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  31.94 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  30.58 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  31.72 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  29.68 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  27.95 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  25.74 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  27.8 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  28.5 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  29.95 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  29.95 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  29.95 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  32.98 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  29.95 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  29.95 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  29.95 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  30.92 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  29.89 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  30.92 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  30.92 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  30.92 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  27.19 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  30.43 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  30.1 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  27.31 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  24.32 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  29.84 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  28.8 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  28.8 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  29.23 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  30.21 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  29.27 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  27.39 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  33.13 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  27.9 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  27.16 
 
 		 267 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  26.64 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  26.99 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  27 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0434  hypothetical protein  25.9 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  29.03 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  29.26 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  39.53 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  39.53 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  39.53 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  26.06 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  26.99 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  27.39 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  25.52 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  26.82 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  27.75 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  32.28 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  23.81 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  28.79 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  23.03 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  24.66 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  25.61 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  24.44 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  24.73 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  26.29 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  25.26 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  22.53 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  23.99 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  25.21 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  23.21 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>