76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0043 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0043  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1533  Protein of unknown function DUF2236  46.63 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  35.15 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  35.15 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  35.15 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  35.59 
 
 		 351 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  34.36 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  34.57 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  35.12 
 
 		 351 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  35.12 
 
 		 351 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  35.12 
 
 		 351 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  29.14 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  31.47 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  30.21 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  34.59 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  29.62 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  33.93 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  30.16 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  30.16 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  29.08 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  26.19 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  32.7 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  27.22 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  25.24 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  25.88 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  26.92 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  26.25 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  26.32 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  26.54 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  25.62 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  26.25 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  27.03 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  26.81 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  26.9 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  25.73 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  25.73 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  23.42 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  24.69 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  26.16 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  26.16 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  26.25 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  24.85 
 
 		 301 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  24.28 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  25.86 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  25.86 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  25.62 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  25.73 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  25.86 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  25.73 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  25.73 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  25.29 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  25.73 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  25.14 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  25.87 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  26.04 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  32.11 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  26 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  23.24 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  25.44 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  25.62 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  23.57 
 
 		 281 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  21.48 
 
 		 339 aa  45.4  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  23.46 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  23.26 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  24.84 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  28.97 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  23.78 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  28.16 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  28.16 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  24.53 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  21.34 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  21.34 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  21.34 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  23.39 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  24.23 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>