80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3134 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 334 aa  675    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  52.43 
 
 		 294 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  52.43 
 
 		 294 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  52.43 
 
 		 294 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  49.47 
 
 		 339 aa  259  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  43.34 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  43.56 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  35.77 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  28.91 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  28.33 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  28.36 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  28.36 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  27.68 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  28.99 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  28.22 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  27.07 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  28.03 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  30.04 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  28.23 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0434  hypothetical protein  27.24 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  25.27 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  26.14 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  24.32 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  25.46 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  28.4 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  28.4 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  27.52 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  27.52 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  27.54 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  28.02 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  24.76 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  24.76 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  25.08 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  25.21 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0739  hypothetical protein  26.34 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845921  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0759  hypothetical protein  26.34 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363352  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  26.34 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0745  hypothetical protein  26.34 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5273  hypothetical protein  23.53 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  24.27 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  26.46 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  23.74 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  24.25 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  26.1 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  27.02 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0968  hypothetical protein  25.1 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  30.06 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  27.48 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  25.51 
 
 		 271 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  27.69 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  21.32 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  25.38 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  29.49 
 
 		 326 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  27.12 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  26.27 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  28.48 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  28.38 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  25.9 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  26.52 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  26.52 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  28.86 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  27.6 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  26.52 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  28.12 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  28.12 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  26.14 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  26.61 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  23.53 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  27.56 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  26.42 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  26.34 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  22.8 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  25.14 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  22.56 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  27.66 
 
 		 282 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  26.39 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  26.39 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  28.57 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>