44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0745 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0745  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  641    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0759  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  641    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363352  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0739  hypothetical protein  98.74 
 
 
318 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845921  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5273  hypothetical protein  74.84 
 
 
322 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0968  hypothetical protein  78.06 
 
 
319 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  26.73 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  26.73 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  26.73 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  28.18 
 
 
320 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  26.8 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  25.88 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  27.27 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  27.47 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  29.22 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  26.17 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  24.52 
 
 
351 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  25.59 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  26.98 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  25.59 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  25.24 
 
 
351 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  23.7 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  23.98 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  23.81 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  26.74 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  26.55 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  27.8 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  25.23 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  25.23 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  25.23 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  23.33 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  25.35 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  27.18 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  27.68 
 
 
271 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  24 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  24.76 
 
 
342 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  29.13 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  25.96 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  28.82 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  24.89 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  24.89 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  24.38 
 
 
315 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  25.12 
 
 
298 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  26.4 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  25.94 
 
 
284 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>