134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0861 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  37.5 
 
 		 272 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  38.89 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  38.63 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  36.74 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  32.23 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  34.25 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  39.06 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  37.7 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  39.58 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  35.14 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  40.29 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  32.64 
 
 		 268 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  34.87 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  32.9 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  31.72 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  30.88 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  32.12 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  33.46 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  33.09 
 
 		 314 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  33.2 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  32.41 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  32.41 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  33.86 
 
 		 257 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  32.82 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  32.02 
 
 		 317 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  30.65 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  30.32 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  30.32 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  30.11 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  31.77 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  32.49 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  34.71 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  32.28 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  34.69 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  31.41 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  31.41 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  36.71 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  33.5 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  31.41 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  31.41 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  31.41 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  31.41 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  29.64 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  30.47 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  30.86 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  29.59 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  29.93 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  35.81 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  30.04 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  29.67 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  44.34 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  30.35 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  30.56 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  30.56 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  44.34 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  30.56 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  44.34 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  32 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  30.77 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  31.43 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  30.04 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  31.79 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  34.29 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  42.02 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  28.29 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  27.39 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  30 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  30.53 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  30.24 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  29.6 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  30.08 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  38.52 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  38.52 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  27.71 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  30.68 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  27.38 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  27.38 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  27.39 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  31.49 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  28.42 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  28.38 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  28.46 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  27.65 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  27.27 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  37.07 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  27.27 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  31.55 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  27.27 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  36.89 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  30.95 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  27.48 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  30.73 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  28.29 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  31.18 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  26.79 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  27.24 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  35.34 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>