112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05300 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  594  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  83.73 
 
 		 298 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  83.73 
 
 		 298 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  66.31 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  61.94 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  60.68 
 
 		 318 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  60.34 
 
 		 318 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  60.34 
 
 		 318 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  60.34 
 
 		 318 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  64.79 
 
 		 279 aa  341  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  60.34 
 
 		 318 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  60.34 
 
 		 318 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  60.34 
 
 		 318 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  61.46 
 
 		 317 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  61.73 
 
 		 314 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  60.65 
 
 		 317 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  61.37 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  61.37 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  60.42 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  60.93 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  59.03 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  60.87 
 
 		 296 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  55.4 
 
 		 289 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  55.28 
 
 		 288 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  54.01 
 
 		 289 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  55.28 
 
 		 288 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  53.66 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  55.14 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  55.14 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  53.31 
 
 		 289 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  54.84 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  54.67 
 
 		 288 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  51.59 
 
 		 290 aa  285  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  40.49 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  47.83 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  43.86 
 
 		 322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  52.88 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  42.75 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  38.46 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  34.96 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  39.22 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  38.58 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  38.65 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  39.86 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  38.25 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  38.25 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  40.39 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  39.38 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  39.03 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  37.39 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  39.23 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  41.76 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  35.06 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  32.07 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  37.44 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  36.33 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  43.72 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  34.93 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  34.63 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  33.6 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  35.45 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  32.96 
 
 		 347 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  43.7 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  26.83 
 
 		 330 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  26.83 
 
 		 330 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  29.27 
 
 		 336 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  26.83 
 
 		 330 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  29.07 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  31.82 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  34.93 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  34.27 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  30.11 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  31.84 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  35.06 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  29.89 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  30.39 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  28.87 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  31.28 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  31.08 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  29.12 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  26.72 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  26.72 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  26.72 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  27.82 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  29.11 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  25.44 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  32.43 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  27.72 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  27.72 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  28.21 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  25.14 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  23.71 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  26.67 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  32.99 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  27.49 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  26.5 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  32.68 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  26.74 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  28.08 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>