129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1212 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  33.21 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  31.37 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  34.15 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  32.45 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  32.44 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  32.44 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  32.44 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  30.86 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  29.85 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  29.74 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  31.67 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  31.67 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  31.99 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  31.87 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  31.67 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  31.22 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  29.23 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  29.23 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  29.23 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  29.17 
 
 		 339 aa  95.9  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  30.71 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  28.91 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  34.3 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  28.95 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  28.14 
 
 		 340 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  28.93 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  28.93 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  28.93 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  27.64 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  27.64 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  29.72 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  27.64 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  32.91 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  29.69 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  28.03 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  29.53 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  30.89 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  27.49 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  29.29 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  30.15 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  27.78 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  26.39 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  29.48 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  29.48 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  27.74 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  28.28 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  28.28 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  28.28 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  28.73 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  30.21 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  28.51 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  30.21 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  28.69 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  29.18 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  28.76 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  25.18 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  30.21 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  28.88 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  26.29 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  29.91 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  29.79 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  29.79 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  29.79 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  29.79 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  28.4 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  27.82 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  29.41 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  28.09 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  28.09 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  29.18 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  28.81 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  28.21 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  25.67 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  27.84 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  27.8 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  27.43 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  28.1 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  27.63 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  26.89 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  31.55 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  27.35 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  27.87 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  29.34 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  27.87 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  27.87 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  27.61 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  28.09 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  27.87 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  28.28 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0434  hypothetical protein  24.63 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  25.67 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  29.41 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  24.26 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  29.8 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  28.65 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>