41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0434 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0434  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  43.07 
 
 
294 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  31.34 
 
 
294 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  31.34 
 
 
294 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  31.34 
 
 
294 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  25.81 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  30.48 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  27.24 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  27.61 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  27.61 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  27.61 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  27.21 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  27.67 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  26.62 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  26.34 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  27.34 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  27.1 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  25.38 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  25.45 
 
 
351 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  25.45 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  25.45 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  24.73 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  24.29 
 
 
340 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  23.81 
 
 
355 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  27.78 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  26.96 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  27.54 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  27.14 
 
 
261 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  29.25 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  26.2 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  26.2 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  26.2 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  25.83 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  25 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  26.2 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  26.71 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  29.66 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0435  hypothetical protein  55.81 
 
 
64 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  22.38 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  32.89 
 
 
301 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  22.6 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>