117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4257 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 
290 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  51.89 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  45.76 
 
 
302 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  46.79 
 
 
305 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  45.08 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  45.69 
 
 
281 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  48.11 
 
 
335 aa  205  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  39.78 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  44.4 
 
 
282 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  42.21 
 
 
279 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  43.03 
 
 
310 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  41.1 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  41.67 
 
 
317 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  42.08 
 
 
314 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  41.67 
 
 
317 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  42.08 
 
 
314 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  41.56 
 
 
317 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  41.67 
 
 
317 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  39.51 
 
 
298 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  39.51 
 
 
298 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  39.38 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  40.27 
 
 
289 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  38.68 
 
 
298 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  38.66 
 
 
313 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  43.81 
 
 
289 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  43.9 
 
 
288 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  39.82 
 
 
289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  39.38 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  39.08 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  37.92 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  39.08 
 
 
318 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  39.08 
 
 
318 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  39.08 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  39.08 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  39.08 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  41.85 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  39.08 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  42.56 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  38.14 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  42.29 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  39.11 
 
 
288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  37.17 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  42.29 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  37.45 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  41.4 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  35.86 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  36.24 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  33.05 
 
 
347 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  35.91 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  37.5 
 
 
298 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  32.66 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  36.65 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  36.89 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  37.67 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  32.03 
 
 
286 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  30.53 
 
 
298 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  36.2 
 
 
256 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  38.67 
 
 
285 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  36.26 
 
 
299 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  34.76 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  34.75 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  35.06 
 
 
306 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  33.52 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  35.83 
 
 
287 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  33.71 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  30.53 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  29.57 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  31.46 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  32.5 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  28.38 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  34.67 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  26.69 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  27.91 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  31.05 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  27.41 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  26.96 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  29.27 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  26.41 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  30.43 
 
 
351 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  29.82 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  29.11 
 
 
320 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  27.92 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  30.17 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  26.46 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  26.46 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  26.46 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  25 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  25 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  31.78 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  25 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  24.03 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  25.93 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  25.63 
 
 
334 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  29.95 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  27.23 
 
 
364 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  28.02 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  27.82 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  27.22 
 
 
303 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>