81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5110 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  83.63 
 
 
336 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  70.27 
 
 
330 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  69.67 
 
 
330 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  69.67 
 
 
330 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  66.07 
 
 
364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  31.4 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  33.21 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  30.17 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  29.25 
 
 
320 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  31.85 
 
 
303 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  29.96 
 
 
279 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  27.61 
 
 
313 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  31 
 
 
288 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  29.56 
 
 
318 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  29.13 
 
 
289 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  30.41 
 
 
298 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  30.41 
 
 
298 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  28.52 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  30.15 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  28.38 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  29.13 
 
 
289 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  29.53 
 
 
289 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  30.91 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  30.91 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  30.91 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  32.82 
 
 
293 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  31.71 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  30.91 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  29.53 
 
 
289 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  28.68 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  28.68 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  30 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  29.2 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  29.2 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  30.15 
 
 
314 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  30.15 
 
 
314 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  29.13 
 
 
288 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  26.26 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  27.92 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  32.31 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  32.47 
 
 
290 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  27.34 
 
 
286 aa  89.4  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  29.74 
 
 
299 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  30.04 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  29.2 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  30.2 
 
 
289 aa  86.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  31.05 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  30.53 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  30.53 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  30.53 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  32.45 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  29.53 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  27.16 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  28.03 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  27.12 
 
 
256 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  29.57 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  26.41 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  27.37 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  28.49 
 
 
287 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  27.89 
 
 
298 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  27.13 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  30.9 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  25.53 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  27.82 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  39.19 
 
 
364 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  30.49 
 
 
304 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  26.37 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  30.99 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  30.99 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  26.19 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  28.31 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  30.99 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  27.08 
 
 
282 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  27.78 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  30 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  32.69 
 
 
298 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  29.27 
 
 
267 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  26.7 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>