43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5273 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5273  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0968  hypothetical protein  82.61 
 
 
319 aa  484  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0745  hypothetical protein  74.84 
 
 
318 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0739  hypothetical protein  74.84 
 
 
318 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845921  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0759  hypothetical protein  74.84 
 
 
318 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363352  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  27.08 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  27.15 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  25.27 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  25.27 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  25.27 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  22.27 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  26.1 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  25.74 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  32.66 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  25.84 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  25.84 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  25.84 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  23.88 
 
 
355 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  27.31 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  23.13 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  24.53 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  22.97 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  24.79 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  26.84 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  25.54 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  26.84 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  23.87 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  27.75 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  26.6 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  26.58 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  26.57 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  27.46 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  23.5 
 
 
339 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  25.88 
 
 
303 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  25.88 
 
 
303 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  25.44 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  26.56 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  24.15 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  24.25 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  30.32 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  26.34 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  26.94 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  27.76 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>