45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1533 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1533  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0043  Protein of unknown function DUF2236  45.91 
 
 		 263 aa  171  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  34.36 
 
 		 304 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  34.36 
 
 		 351 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  34.13 
 
 		 355 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  29.51 
 
 		 309 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  32.93 
 
 		 340 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  32.34 
 
 		 351 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  28.75 
 
 		 303 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  28.75 
 
 		 303 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  32.34 
 
 		 351 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  28.33 
 
 		 303 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  32.34 
 
 		 351 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  32.34 
 
 		 351 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  30.36 
 
 		 302 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  33.56 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  33.78 
 
 		 339 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  32.65 
 
 		 339 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  30.91 
 
 		 311 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  30.91 
 
 		 311 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  30.91 
 
 		 334 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  29.44 
 
 		 364 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  28.66 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  27.5 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  30.34 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  25.26 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  32.1 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  34.78 
 
 		 322 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  29.83 
 
 		 326 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  27.56 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  29.21 
 
 		 288 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  27.56 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  23.75 
 
 		 307 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  23.84 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  29.52 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  27.44 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  26.51 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  28.37 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  27.43 
 
 		 310 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  26.53 
 
 		 285 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  27.66 
 
 		 318 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  27.66 
 
 		 318 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  26.32 
 
 		 325 aa  41.6  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>