More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0829 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  38.38 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  32.51 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  31.1 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  38.71 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  38.71 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  38.71 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  39.13 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  38.01 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  38.71 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  38.71 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  40.44 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  38.71 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  39.04 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  37.63 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  32.75 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  32.75 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  35.78 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  40.4 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  36.71 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  35.78 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  36.99 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  36.41 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  28.95 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  38.75 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  34.44 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  35.03 
 
 		 288 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  32.69 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  30.17 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  34.76 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  34.64 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  36.22 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  44.12 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  33.52 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  45.45 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  38.6 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  39.62 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  34.25 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.41 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  38.27 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  38.73 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  34.53 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  35.26 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  39.22 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  35.29 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  34.81 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  41.77 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.71 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  31.94 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  27.75 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  31.41 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  33.69 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  30.33 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  35.18 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  32.07 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  35.66 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  35.8 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.5 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.67 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  32.56 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.46 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3511  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175158  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  32.62 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  30.48 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  28.64 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.27 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  37.21 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  37.96 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  34.05 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  35.29 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  31.15 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  35.15 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  32.78 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1094  glutamine amidotransferase class-I  35.4 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  32.09 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  34.64 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  37.14 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3244  glutamine amidotransferase class-I  33.14 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3255  glutamine amidotransferase class-I  33.14 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3306  glutamine amidotransferase class-I  33.14 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0142588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  36.53 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  35 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  34.57 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  31.1 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  30.94 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>