58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2709 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1184  ATPase  38.19 
 
 
1071 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  100 
 
 
1106 aa  2269    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  34.66 
 
 
1076 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  34.03 
 
 
1043 aa  559  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  33.54 
 
 
1031 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  28.83 
 
 
1046 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  34.44 
 
 
1144 aa  318  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  39.04 
 
 
1100 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  30.85 
 
 
886 aa  271  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  36.54 
 
 
1104 aa  249  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  36.42 
 
 
319 aa  189  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  21.56 
 
 
1050 aa  127  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  26.3 
 
 
658 aa  86.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  25.47 
 
 
653 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  24.5 
 
 
800 aa  83.2  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  24.3 
 
 
847 aa  67.8  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  23.93 
 
 
859 aa  66.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  24.29 
 
 
859 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  23.35 
 
 
762 aa  65.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  23.89 
 
 
802 aa  63.9  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.68 
 
 
608 aa  63.5  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.28 
 
 
496 aa  63.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  22.47 
 
 
847 aa  62.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.63 
 
 
524 aa  60.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  21.69 
 
 
563 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.9 
 
 
611 aa  58.9  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  23.66 
 
 
764 aa  57.4  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  20.25 
 
 
531 aa  57  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  23.06 
 
 
753 aa  53.5  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  25.67 
 
 
546 aa  52.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  21.96 
 
 
605 aa  52.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.08 
 
 
523 aa  52  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.68 
 
 
616 aa  52  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  24.17 
 
 
569 aa  51.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  25.21 
 
 
569 aa  50.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0152  hypothetical protein  33.64 
 
 
664 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.038472 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  21.65 
 
 
559 aa  50.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  22.44 
 
 
516 aa  50.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  22.56 
 
 
578 aa  48.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  23.33 
 
 
581 aa  48.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  24.54 
 
 
544 aa  48.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  26.95 
 
 
537 aa  48.1  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  24.07 
 
 
250 aa  47.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  22.96 
 
 
499 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  23.27 
 
 
499 aa  47.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  23.95 
 
 
571 aa  47  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  25.88 
 
 
550 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  25.23 
 
 
582 aa  46.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  29.36 
 
 
523 aa  46.6  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0091  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.13 
 
 
488 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0259973  normal  0.193086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  24.37 
 
 
517 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  21.89 
 
 
709 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  25.86 
 
 
564 aa  46.2  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  26.79 
 
 
582 aa  46.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.53 
 
 
557 aa  45.4  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  22.66 
 
 
579 aa  45.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  27.12 
 
 
606 aa  45.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  20.83 
 
 
505 aa  45.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>