184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0204 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 68 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1892  heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  44.62 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 839 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 73 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477053 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  40.35 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  40.32 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0448  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.268812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0415  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  39.66 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 827 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  38.71 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  42.03 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  38.71 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 		 868 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  44.44 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 799 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  44.44 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  45.9 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 799 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 827 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0386  copper-transporter protein CopZ  31.34 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  38.46 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 833 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  50.88 
 
 		 770 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  43.86 
 
 		 792 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 840 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 835 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 826 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  42.19 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 797 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  36.84 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  42.11 
 
 		 792 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  41.07 
 
 		 852 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 847 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 810 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 841 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  41.51 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.33 
 
 		 826 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 790 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 799 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 855 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 800 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.32 
 
 		 819 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  41.51 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 762 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 762 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>