40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2358 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  885    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  46.05 
 
 
418 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  45.77 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  47.2 
 
 
418 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  47.2 
 
 
418 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  43.3 
 
 
424 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  41.59 
 
 
423 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  40.18 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  41.72 
 
 
423 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  41.72 
 
 
423 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  40.32 
 
 
423 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  41.72 
 
 
423 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  39.91 
 
 
423 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  34.35 
 
 
412 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  34.15 
 
 
414 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  28.71 
 
 
533 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  27.87 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  38.3 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  43.75 
 
 
356 aa  57  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  48 
 
 
319 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  31.28 
 
 
323 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  42.62 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  26.75 
 
 
534 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  26.32 
 
 
356 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  23.88 
 
 
422 aa  49.7  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  53.66 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  37.18 
 
 
596 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  50 
 
 
372 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  42.11 
 
 
349 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  32.35 
 
 
666 aa  47.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  27.59 
 
 
445 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  44.9 
 
 
455 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  32.82 
 
 
298 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  49.06 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1733  hypothetical protein  32.39 
 
 
177 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3250  membrane protein-like  35.21 
 
 
573 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  39.34 
 
 
417 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  46.81 
 
 
406 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  28.57 
 
 
568 aa  43.9  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  32.69 
 
 
625 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>