33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3250 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3250  membrane protein-like  100 
 
 		 573 aa  1100    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  28.57 
 
 		 590 aa  94.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  28.57 
 
 		 596 aa  94.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  26.3 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  31.84 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  32.64 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  29.84 
 
 		 556 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  29.95 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  32.6 
 
 		 596 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  25.74 
 
 		 542 aa  62.4  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  28.9 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  29.47 
 
 		 602 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  33.48 
 
 		 648 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  30 
 
 		 602 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  30 
 
 		 602 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  30 
 
 		 602 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  30 
 
 		 602 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  29.69 
 
 		 602 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  30.07 
 
 		 568 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  26.79 
 
 		 678 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  29.69 
 
 		 602 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  27.74 
 
 		 651 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  27.18 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  28.72 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  28.72 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  29.84 
 
 		 603 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  28.54 
 
 		 566 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2439  membrane protein-like  32.93 
 
 		 317 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  26 
 
 		 571 aa  47.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  30.9 
 
 		 563 aa  47.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  30.08 
 
 		 621 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  33.93 
 
 		 412 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  33.57 
 
 		 672 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>