46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0150 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  100 
 
 		 812 aa  1618    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  56.45 
 
 		 818 aa  803    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  47.97 
 
 		 819 aa  703    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3330  hypothetical protein  38.68 
 
 		 783 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0454731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  31.95 
 
 		 828 aa  347  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  30.91 
 
 		 827 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  30.96 
 
 		 821 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2791  hypothetical protein  29.62 
 
 		 806 aa  290  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  30.69 
 
 		 889 aa  202  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  25.57 
 
 		 766 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  35.56 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  32.84 
 
 		 692 aa  67.8  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  25.25 
 
 		 982 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2591  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  54.7  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000151493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  36.92 
 
 		 903 aa  55.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  28.35 
 
 		 304 aa  52.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  31.65 
 
 		 983 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  28.68 
 
 		 837 aa  51.6  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  32.5 
 
 		 284 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  25.4 
 
 		 349 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  23.68 
 
 		 805 aa  49.3  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  30.83 
 
 		 286 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  27.27 
 
 		 283 aa  48.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  26.34 
 
 		 819 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  26.32 
 
 		 502 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  27.27 
 
 		 782 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  32.61 
 
 		 320 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  32.61 
 
 		 320 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  23.74 
 
 		 471 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  27.17 
 
 		 248 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  24.46 
 
 		 803 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  23.81 
 
 		 375 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  28.25 
 
 		 305 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  26.11 
 
 		 1078 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  26.11 
 
 		 1078 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  29.77 
 
 		 279 aa  45.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  26.45 
 
 		 280 aa  45.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  26.56 
 
 		 533 aa  45.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  25.62 
 
 		 283 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  25.41 
 
 		 285 aa  45.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1079 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  25.42 
 
 		 817 aa  44.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  34.78 
 
 		 519 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  32.86 
 
 		 875 aa  44.3  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  25.62 
 
 		 283 aa  44.3  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  31.65 
 
 		 521 aa  44.3  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>