38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0428 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  37.68 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  29.92 
 
 		 265 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  41.94 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  41.83 
 
 		 275 aa  118  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  35.82 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  40.51 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  38.96 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  36.88 
 
 		 264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  45.71 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  39.88 
 
 		 262 aa  109  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.31 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  35.67 
 
 		 305 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  40.61 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  39.49 
 
 		 259 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  37.16 
 
 		 273 aa  101  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  37.99 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  32.86 
 
 		 320 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  35.9 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  35.19 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  36.02 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  42.47 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  33.68 
 
 		 180 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  33.16 
 
 		 180 aa  94.7  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  33.16 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  35.45 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  34.18 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  35.59 
 
 		 333 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  29.59 
 
 		 360 aa  92  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  35.29 
 
 		 247 aa  88.6  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  33.93 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  38.46 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  26.27 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  28.04 
 
 		 350 aa  78.6  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  33.88 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  30 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  27.18 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  29.44 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>