More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0900 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 
223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  86.76 
 
 
211 aa  346  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.87 
 
 
206 aa  320  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  76.8 
 
 
217 aa  315  3e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  76.47 
 
 
214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  54.08 
 
 
201 aa  229  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  53.33 
 
 
206 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 
202 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
197 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
197 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.21 
 
 
197 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  48.22 
 
 
201 aa  201  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  51.03 
 
 
202 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  48.69 
 
 
201 aa  197  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  48.99 
 
 
210 aa  194  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.97 
 
 
207 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.45 
 
 
207 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.24 
 
 
204 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.4 
 
 
201 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.19 
 
 
206 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.19 
 
 
206 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.39 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  45.13 
 
 
206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  40.76 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.56 
 
 
207 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  40.2 
 
 
202 aa  162  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  41.24 
 
 
209 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 
201 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 
201 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  38.1 
 
 
201 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2092  isopropylmalate isomerase small subunit  37.43 
 
 
200 aa  125  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  37.5 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  37.5 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  36.41 
 
 
201 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  38.1 
 
 
201 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 
201 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.36 
 
 
201 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1886  isopropylmalate isomerase small subunit  36.87 
 
 
200 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  39.89 
 
 
204 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  35.79 
 
 
200 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 
201 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 
201 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 
201 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  34.36 
 
 
201 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 
200 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0014  isopropylmalate isomerase small subunit  36.87 
 
 
200 aa  121  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  35.84 
 
 
201 aa  121  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.52 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  34.21 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  38.01 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  35.4 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  38.07 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  36.65 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.36 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  35.59 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  34.97 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  35.12 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  34.52 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  32.47 
 
 
214 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 
208 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3568  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.21 
 
 
203 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  34.03 
 
 
201 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  32.63 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  33.69 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  32.11 
 
 
200 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.33 
 
 
201 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35 
 
 
197 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  32.28 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  31.58 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  36.07 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  32.66 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  32.66 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  34.04 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  36.07 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  36.9 
 
 
722 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  32.77 
 
 
201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  36.73 
 
 
201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  36.11 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  34.03 
 
 
201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  33.86 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  32.79 
 
 
209 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  30.53 
 
 
200 aa  113  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  37.77 
 
 
197 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  32.98 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  31.98 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  31.58 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  30.89 
 
 
215 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  32.99 
 
 
201 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  32.99 
 
 
201 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  33.88 
 
 
200 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  32.99 
 
 
201 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  30.89 
 
 
215 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.85 
 
 
195 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.03 
 
 
195 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  34.22 
 
 
201 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  33.83 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  32.98 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>