32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3622 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  100 
 
 		 673 aa  1276    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  60.93 
 
 		 663 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  67.95 
 
 		 697 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  68.29 
 
 		 651 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  68.14 
 
 		 617 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  66.56 
 
 		 727 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  67.09 
 
 		 306 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  58.2 
 
 		 666 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  58.2 
 
 		 624 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  55.45 
 
 		 348 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  44.15 
 
 		 742 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 742 aa  238  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  42.62 
 
 		 739 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  44.06 
 
 		 880 aa  232  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  42.95 
 
 		 703 aa  210  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 701 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.2 
 
 		 701 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 		 711 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  56.52 
 
 		 730 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.12 
 
 		 2449 aa  76.3  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  36.21 
 
 		 208 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  36.62 
 
 		 222 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  37.17 
 
 		 212 aa  63.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  41.44 
 
 		 1619 aa  62.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  38.33 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  32.5 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>