More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3274 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  100 
 
 		 267 aa  542  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  61.36 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  57.95 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  56.44 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  56.44 
 
 		 270 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  55.3 
 
 		 270 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  47.01 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  47.89 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  49.81 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  48.66 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  50 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  48.28 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  44.06 
 
 		 292 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  46.27 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  43.13 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  47.89 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  41.38 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  41.6 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  39.41 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  37.12 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  31.73 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  31.73 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  31.73 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  31.73 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.73 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  31.05 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.6 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  31.6 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.2 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  30.77 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  31.08 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30.74 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.97 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  26.89 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  26.32 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.3 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.31 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.3 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  26.52 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.31 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  27.3 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  30.26 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  27.3 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  27.31 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  27.31 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  27.54 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  26.14 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  26.14 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  26.14 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  28.04 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  26.14 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.04 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.62 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  26.14 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  28.04 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  28.04 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  25.73 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  26.14 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  27.39 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  28.31 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  22.1 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  27.14 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4533  hypothetical protein  28.09 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  24.2 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  26.94 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  27.68 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.68 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.68 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.68 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  27.53 
 
 		 292 aa  89  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1405  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  22.35 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  25.73 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4607  hypothetical protein  28.09 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  23.7 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  24.75 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  27.08 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  27.96 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  26.81 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  26.77 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.39 
 
 		 272 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  28.22 
 
 		 306 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  24.81 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25.36 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  27.47 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.28 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  27.07 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  28.95 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.2 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  26.39 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>