41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4465 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 164 aa  327  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  43.24 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  43.54 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  39.57 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  34.01 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  38.3 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  38.06 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  33.09 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  32.87 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  30.82 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  30.07 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  29.05 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  30.71 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  30.57 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  31.88 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  31.88 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  31.88 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  33.54 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  34.03 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  24.16 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  28.03 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  29.66 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  30.97 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  30.22 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  29.73 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  26.06 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  27.15 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  27.63 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  24.84 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  32.86 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  30.13 
 
 		 239 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  35.64 
 
 		 316 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  27.14 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 174 aa  42  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  26.09 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  25.36 
 
 		 241 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>