More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3307 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15910  DNA topoisomerase IV subunit B  63.35 
 
 		 709 aa  891    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.39843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1922  DNA topoisomerase IV subunit B  64.07 
 
 		 708 aa  844    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  0.0348119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 701 aa  1424    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13260  DNA topoisomerase IV subunit B  65.29 
 
 		 701 aa  874    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0630779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2280  DNA gyrase subunit B domain protein  52.61 
 
 		 680 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.557074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  82.69 
 
 		 702 aa  1191    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7084  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  73.22 
 
 		 690 aa  981    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1534  DNA topoisomerase IV subunit B  65.66 
 
 		 693 aa  883    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300498  normal  0.0102248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15990  DNA topoisomerase IV subunit B  66.43 
 
 		 710 aa  917    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.440467  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1763  DNA topoisomerase IV subunit B  68.67 
 
 		 709 aa  949    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08220  DNA topoisomerase IV subunit B  53.84 
 
 		 701 aa  716    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0298  DNA topoisomerase plasmid partition protein B  52.89 
 
 		 758 aa  792    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1680  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  55.03 
 
 		 702 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.313615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1613  DNA topoisomerase IV subunit B  64.91 
 
 		 702 aa  902    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000263124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2394  DNA topoisomerase  73.22 
 
 		 690 aa  984    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367142  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1611  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  73.68 
 
 		 696 aa  1023    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00143665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2055  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  63.7 
 
 		 713 aa  861    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1619  DNA topoisomerase IV subunit B  64.48 
 
 		 702 aa  900    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0681707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1427  DNA topoisomerase IV subunit B  64.11 
 
 		 703 aa  857    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14380  DNA topoisomerase IV subunit B  63.95 
 
 		 705 aa  891    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2958  DNA topoisomerase IV subunit B  68.31 
 
 		 710 aa  965    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414962  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1988  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.16 
 
 		 715 aa  905    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1425  DNA topoisomerase IV subunit B  63.03 
 
 		 723 aa  890    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1674  DNA gyrase subunit B  54.45 
 
 		 730 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.759972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  46.55 
 
 		 644 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  46.99 
 
 		 628 aa  570  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  46.3 
 
 		 636 aa  571  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  45.86 
 
 		 636 aa  567  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  42.86 
 
 		 675 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  44.91 
 
 		 645 aa  553  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  44.54 
 
 		 649 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  44.3 
 
 		 642 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  44.17 
 
 		 632 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  42.98 
 
 		 640 aa  551  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  46.15 
 
 		 633 aa  547  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  44.87 
 
 		 636 aa  548  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  43.95 
 
 		 648 aa  548  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  45.68 
 
 		 650 aa  544  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  42.35 
 
 		 650 aa  543  1e-153  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.63 
 
 		 633 aa  545  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  46.06 
 
 		 651 aa  545  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  45.41 
 
 		 650 aa  545  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  42.82 
 
 		 647 aa  542  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  44.2 
 
 		 648 aa  539  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  46.52 
 
 		 637 aa  539  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  44.51 
 
 		 643 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  45.4 
 
 		 640 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  44.06 
 
 		 644 aa  541  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  44.52 
 
 		 644 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  43.22 
 
 		 686 aa  539  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  42.61 
 
 		 637 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  44.24 
 
 		 643 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  44.77 
 
 		 656 aa  538  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  45.17 
 
 		 649 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  45.23 
 
 		 661 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  44.2 
 
 		 627 aa  534  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  42.9 
 
 		 642 aa  534  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  44.94 
 
 		 654 aa  534  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  44.15 
 
 		 633 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  45.75 
 
 		 640 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  42.57 
 
 		 650 aa  532  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  45.49 
 
 		 695 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  44.02 
 
 		 696 aa  532  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  44.57 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  44.01 
 
 		 644 aa  528  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  43.78 
 
 		 655 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  45.09 
 
 		 637 aa  531  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  44.78 
 
 		 655 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  45.35 
 
 		 636 aa  531  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  43.95 
 
 		 650 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  43.99 
 
 		 634 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  44.43 
 
 		 652 aa  529  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  45.27 
 
 		 657 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  43.57 
 
 		 658 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  44.02 
 
 		 651 aa  531  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.73 
 
 		 641 aa  530  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  42.8 
 
 		 665 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  43.77 
 
 		 637 aa  526  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  46.02 
 
 		 645 aa  527  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  45.6 
 
 		 640 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1634  DNA gyrase, B subunit  41.49 
 
 		 708 aa  528  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000582851  hitchhiker  0.000898108 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  47.21 
 
 		 655 aa  527  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  45.24 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  44.57 
 
 		 635 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  44.61 
 
 		 644 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  42.84 
 
 		 634 aa  525  1e-147  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  43.98 
 
 		 642 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  45.44 
 
 		 696 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.77 
 
 		 644 aa  523  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  43.5 
 
 		 643 aa  519  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  45.1 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  44.8 
 
 		 640 aa  519  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  46.22 
 
 		 661 aa  521  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  44.95 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  42.5 
 
 		 660 aa  520  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  43.33 
 
 		 635 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  44.95 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  42.8 
 
 		 641 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  44.98 
 
 		 672 aa  522  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  44.93 
 
 		 641 aa  521  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>