62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1897 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 319 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  67.54 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  51.62 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  46.07 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  53.07 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  46.5 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  44.96 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.98 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  37.92 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.25 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  39.81 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  37.45 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.59 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  36.59 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  37.02 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.15 
 
 		 282 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.16 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.28 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  34.02 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  33.45 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.82 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.6 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.7 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  29.65 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  30.82 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  32.13 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.15 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  38.38 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.33 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  25.95 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  31.23 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  33.55 
 
 		 169 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.62 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  33.01 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  27.07 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  34.11 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  32.2 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  32.81 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  27.44 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.74 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  29.72 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  32.41 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  27.78 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  38.14 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.45 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  35.43 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.95 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>