More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1376 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1376  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
363 aa  725    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.482993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  52.44 
 
 
353 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.44 
 
 
364 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  52.44 
 
 
353 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  52.44 
 
 
353 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.44 
 
 
364 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.44 
 
 
353 aa  347  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.44 
 
 
364 aa  346  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4226  alcohol dehydrogenase  49.57 
 
 
352 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.31 
 
 
345 aa  330  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7277  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.5 
 
 
351 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6852  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
340 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1825  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.14 
 
 
351 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.700664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7304  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.84 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554386  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1821  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00641517  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
358 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  31.64 
 
 
335 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.27 
 
 
341 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.47 
 
 
346 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.05 
 
 
352 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1941  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.3 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  28.57 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.88 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  29.36 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.5 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.71 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 
349 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  27.11 
 
 
345 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.91 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.13 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  29.41 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  29.84 
 
 
348 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.14 
 
 
346 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.25 
 
 
356 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  27.02 
 
 
338 aa  113  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  29.41 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4593  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.04 
 
 
346 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.675343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11924  dehydrogenase  33.7 
 
 
384 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
350 aa  110  5e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  34.03 
 
 
342 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.21 
 
 
338 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.65 
 
 
346 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 
345 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  26.33 
 
 
336 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  29 
 
 
347 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.44 
 
 
347 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.24 
 
 
347 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
343 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
346 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0396  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
352 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1589  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.98 
 
 
394 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.67 
 
 
347 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.67 
 
 
347 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
341 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
349 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.67 
 
 
347 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  25.45 
 
 
345 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  29.23 
 
 
338 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  26.9 
 
 
341 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
337 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  30.14 
 
 
342 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 
350 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  28.88 
 
 
361 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.46 
 
 
337 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  26.39 
 
 
341 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.33 
 
 
347 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  26.43 
 
 
344 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 
351 aa  107  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  26.2 
 
 
345 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  26.75 
 
 
341 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.36 
 
 
341 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  26.02 
 
 
341 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  26.02 
 
 
341 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19850  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.23 
 
 
400 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.809397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.99 
 
 
344 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  26.32 
 
 
341 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  26.9 
 
 
341 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  26.9 
 
 
341 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.98 
 
 
357 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  26.1 
 
 
341 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
340 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  26.32 
 
 
341 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.03 
 
 
348 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>