More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0709 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  100 
 
 
465 aa  911    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  61.07 
 
 
439 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  52.67 
 
 
442 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  49.55 
 
 
452 aa  359  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  52.46 
 
 
483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  50.59 
 
 
434 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  47.33 
 
 
461 aa  350  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 
464 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  48.63 
 
 
430 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  48.84 
 
 
464 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  47.7 
 
 
454 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  48.82 
 
 
425 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  50.65 
 
 
435 aa  316  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  44.25 
 
 
490 aa  313  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  42.96 
 
 
435 aa  312  9e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  45.21 
 
 
436 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  45.21 
 
 
436 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  45.21 
 
 
436 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  48.71 
 
 
457 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  49.63 
 
 
484 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  43.89 
 
 
437 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  45.98 
 
 
426 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  44.55 
 
 
432 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  44.89 
 
 
432 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  45.98 
 
 
438 aa  286  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  42 
 
 
495 aa  283  7.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  46.29 
 
 
537 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  42.5 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  40.69 
 
 
447 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
448 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  39.62 
 
 
456 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  38.01 
 
 
444 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.34 
 
 
420 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  33.33 
 
 
477 aa  195  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.3 
 
 
421 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  41.43 
 
 
439 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  30.04 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  33.63 
 
 
499 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  30.7 
 
 
422 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  41.94 
 
 
434 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  31.71 
 
 
425 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  45.05 
 
 
476 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 
435 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  36.39 
 
 
441 aa  178  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  38.76 
 
 
420 aa  176  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.42 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  31.28 
 
 
438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  38.78 
 
 
284 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  41.53 
 
 
441 aa  173  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  40.8 
 
 
284 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
276 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  29.4 
 
 
434 aa  170  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  38.26 
 
 
447 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  40.15 
 
 
285 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.66 
 
 
446 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  39.33 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  29.46 
 
 
429 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  32.32 
 
 
447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  37.39 
 
 
434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  39.33 
 
 
287 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
296 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  29.58 
 
 
430 aa  166  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  29.83 
 
 
421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  30.07 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  29.7 
 
 
446 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  32.44 
 
 
421 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.87 
 
 
442 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 
419 aa  160  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  29.21 
 
 
455 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  28.34 
 
 
455 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  32.39 
 
 
259 aa  157  3e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  30.71 
 
 
446 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  27.61 
 
 
468 aa  156  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  28.7 
 
 
424 aa  156  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.56 
 
 
464 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.56 
 
 
442 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.56 
 
 
442 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  39.73 
 
 
250 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  30.32 
 
 
435 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  39.92 
 
 
427 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  30.4 
 
 
423 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  31.46 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.32 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  30.23 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0376  CBS domain containing protein  25.41 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  29.16 
 
 
477 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  27.4 
 
 
487 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.32 
 
 
442 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.07 
 
 
442 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.32 
 
 
442 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  27.82 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
442 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  36.4 
 
 
273 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  37.55 
 
 
285 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  33.82 
 
 
285 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  32.56 
 
 
433 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  39.38 
 
 
298 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  29.56 
 
 
464 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  28.48 
 
 
467 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  29.83 
 
 
442 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>