More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1544 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  100 
 
 
441 aa  878    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  47.32 
 
 
448 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  41.82 
 
 
456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  44.86 
 
 
476 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  48.88 
 
 
452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  49.1 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  47.16 
 
 
483 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  42.35 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  41.99 
 
 
464 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  46.29 
 
 
442 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  47.32 
 
 
434 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  37.54 
 
 
430 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  50.22 
 
 
499 aa  207  4e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  43.31 
 
 
461 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  46.7 
 
 
438 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  45.26 
 
 
443 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  44.59 
 
 
425 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  44.4 
 
 
447 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  49.33 
 
 
477 aa  193  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  44.67 
 
 
454 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  46.75 
 
 
484 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  46.12 
 
 
426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  42.98 
 
 
439 aa  190  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  40.57 
 
 
490 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  44.49 
 
 
495 aa  186  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
457 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  44.77 
 
 
537 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  41.53 
 
 
465 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  41.22 
 
 
435 aa  173  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  40.93 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  29.69 
 
 
420 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  41.1 
 
 
432 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  39.56 
 
 
436 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  36.83 
 
 
437 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  39.56 
 
 
436 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  39.56 
 
 
436 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  43.23 
 
 
441 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 
432 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  25.48 
 
 
445 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  25.48 
 
 
445 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  35.44 
 
 
432 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  38.92 
 
 
434 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
286 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  41.35 
 
 
446 aa  150  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  40.62 
 
 
427 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  29.07 
 
 
425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  38.99 
 
 
421 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 
250 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  40.53 
 
 
291 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  34.6 
 
 
447 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  36.03 
 
 
323 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  32.23 
 
 
439 aa  146  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  37.27 
 
 
444 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.58 
 
 
434 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  34.88 
 
 
421 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  34.66 
 
 
429 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  37.38 
 
 
291 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 
296 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  35.63 
 
 
323 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  38.32 
 
 
311 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  35.32 
 
 
292 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  36.6 
 
 
279 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  39.89 
 
 
279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  33.19 
 
 
284 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  34.15 
 
 
259 aa  140  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  33.78 
 
 
273 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.68 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  37.97 
 
 
439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  38.31 
 
 
281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  39.89 
 
 
279 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  30.69 
 
 
447 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  35.29 
 
 
279 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  33.63 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  35.83 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  39.89 
 
 
280 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  39.89 
 
 
280 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  34.45 
 
 
285 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  36.94 
 
 
279 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  40.21 
 
 
426 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.57 
 
 
435 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  39.18 
 
 
425 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  35.27 
 
 
284 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  34.65 
 
 
285 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  38.83 
 
 
279 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  38.83 
 
 
279 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  38.83 
 
 
279 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.41 
 
 
292 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.46 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.47 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  35.19 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 
419 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  33.47 
 
 
433 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  36.41 
 
 
291 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.35 
 
 
434 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  27.37 
 
 
417 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
291 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  32.88 
 
 
287 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  32.88 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  34.76 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  34.62 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>