More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3385 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  100 
 
 
438 aa  838    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  53.6 
 
 
434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  55.11 
 
 
442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  54.07 
 
 
430 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  52.68 
 
 
461 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  55.31 
 
 
425 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  55.42 
 
 
483 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  51.66 
 
 
452 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  50.37 
 
 
495 aa  368  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  52.11 
 
 
464 aa  363  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  51.4 
 
 
464 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  48.7 
 
 
443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  48.59 
 
 
426 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  48.92 
 
 
490 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  49.07 
 
 
435 aa  345  7e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  48.95 
 
 
436 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  48.95 
 
 
436 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  48.95 
 
 
436 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  46.44 
 
 
437 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  48.43 
 
 
447 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  51.89 
 
 
484 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  47.83 
 
 
454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  49.39 
 
 
457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  47.74 
 
 
456 aa  327  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  46.99 
 
 
435 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  47.81 
 
 
432 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  47 
 
 
439 aa  319  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  47.83 
 
 
432 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  49.52 
 
 
537 aa  312  6.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  44.44 
 
 
465 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  45.83 
 
 
448 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  40.05 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  48.79 
 
 
476 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  36.94 
 
 
477 aa  220  5e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  41.96 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  38.8 
 
 
499 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.3 
 
 
420 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  46.7 
 
 
441 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  34.91 
 
 
434 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.09 
 
 
421 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  36.21 
 
 
420 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  35.23 
 
 
439 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  42.51 
 
 
421 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  27.46 
 
 
455 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.73 
 
 
425 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  29.27 
 
 
442 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  29.27 
 
 
442 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 
442 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  29.51 
 
 
442 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  31.16 
 
 
421 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  29.51 
 
 
442 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  26.5 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  29.27 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.51 
 
 
440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  29.38 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  29.04 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  31.06 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  28.87 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  30.92 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  31.22 
 
 
443 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  40.71 
 
 
284 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  27.51 
 
 
455 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 
432 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
435 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  29.97 
 
 
425 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  29.91 
 
 
446 aa  170  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  27.65 
 
 
430 aa  170  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  29.07 
 
 
432 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30.81 
 
 
451 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  30.4 
 
 
443 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  30.65 
 
 
443 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  33.09 
 
 
447 aa  169  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  29.17 
 
 
432 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  40.87 
 
 
284 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  35.74 
 
 
439 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  28.09 
 
 
437 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  27.63 
 
 
443 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  26.42 
 
 
414 aa  168  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  28.7 
 
 
432 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  28.7 
 
 
432 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.36 
 
 
442 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  36.61 
 
 
296 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  30.2 
 
 
443 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.39 
 
 
424 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  28.28 
 
 
434 aa  166  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  31.46 
 
 
444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30.38 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.41 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  28.47 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.89 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  27.94 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  40.52 
 
 
250 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  28.19 
 
 
432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  28.57 
 
 
444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  34.33 
 
 
426 aa  163  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.14 
 
 
424 aa  162  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>