More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0272 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  100 
 
 
419 aa  851    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  39.9 
 
 
431 aa  326  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  41.16 
 
 
418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  40.05 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  40.15 
 
 
453 aa  289  8e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0935  CBS domain containing protein  34.63 
 
 
464 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  42.96 
 
 
293 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.33 
 
 
420 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  30.18 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  32.7 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  32.92 
 
 
417 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  30.3 
 
 
464 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  32.4 
 
 
467 aa  209  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  32.05 
 
 
438 aa  209  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
422 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  32.84 
 
 
429 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  30.14 
 
 
464 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  34.38 
 
 
425 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  33.49 
 
 
421 aa  206  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  29.84 
 
 
464 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  32.29 
 
 
477 aa  202  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  32.59 
 
 
425 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  32.94 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31.1 
 
 
446 aa  199  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  32.16 
 
 
434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  32.51 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  35.05 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  31.02 
 
 
433 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  32.3 
 
 
424 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  32.28 
 
 
440 aa  196  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  32.31 
 
 
455 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  32.24 
 
 
455 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  31.94 
 
 
443 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  30.09 
 
 
437 aa  193  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  32.35 
 
 
426 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  31.78 
 
 
429 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  32.54 
 
 
470 aa  190  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  30.22 
 
 
465 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  30.86 
 
 
434 aa  189  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.8 
 
 
421 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  32.63 
 
 
445 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  32.63 
 
 
445 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  29.83 
 
 
479 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  29.53 
 
 
442 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  27.91 
 
 
429 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  30.99 
 
 
443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.43 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  36.28 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  30.56 
 
 
429 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  31.5 
 
 
448 aa  184  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  29.81 
 
 
429 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  34.28 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  29.68 
 
 
456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  29.23 
 
 
424 aa  183  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.94 
 
 
424 aa  183  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  29.19 
 
 
442 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  29.84 
 
 
442 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.95 
 
 
421 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  32.4 
 
 
439 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  26.77 
 
 
447 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  28.71 
 
 
421 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  29.3 
 
 
441 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  29.29 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.04 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  29.79 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  27.19 
 
 
440 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  31.84 
 
 
431 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  30.32 
 
 
523 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  32.77 
 
 
427 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  31.55 
 
 
423 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 
435 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  31.29 
 
 
432 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  33.09 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  28.74 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  29.81 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  29.5 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  29.81 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  27.06 
 
 
436 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  28.71 
 
 
495 aa  172  9e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  28.34 
 
 
446 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  29.55 
 
 
445 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  29.88 
 
 
442 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  28.71 
 
 
436 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  27.32 
 
 
428 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  32.33 
 
 
422 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  28.27 
 
 
447 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  31.51 
 
 
443 aa  170  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  28.81 
 
 
434 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  29.81 
 
 
431 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  28.77 
 
 
429 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  30.46 
 
 
426 aa  169  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  28.6 
 
 
432 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2559  protein of unknown function DUF21  30.49 
 
 
410 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.764151  hitchhiker  0.000350536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  28.95 
 
 
428 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  29.79 
 
 
431 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  28.5 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>