More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0542 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
808 aa  1593    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  37.95 
 
 
660 aa  342  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
669 aa  333  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
678 aa  321  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  44.1 
 
 
762 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  40.1 
 
 
383 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  40.31 
 
 
416 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 
390 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 
418 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 
388 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
443 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  39.7 
 
 
435 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  36.36 
 
 
440 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  39.07 
 
 
388 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
394 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
890 aa  190  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 
356 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
361 aa  168  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  36.91 
 
 
357 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1956  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
381 aa  154  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
365 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
374 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.06 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
396 aa  126  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
385 aa  124  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
364 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  24.63 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
364 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
353 aa  115  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
371 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
388 aa  112  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
368 aa  108  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
390 aa  107  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
409 aa  107  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  25.82 
 
 
513 aa  103  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
353 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
384 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
390 aa  101  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
424 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
350 aa  97.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  24.74 
 
 
358 aa  95.1  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1209  putative glycosyltransferase  33.57 
 
 
362 aa  94.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.06 
 
 
386 aa  94.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.68 
 
 
396 aa  94  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  27.75 
 
 
743 aa  92  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12403  Glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
361 aa  90.9  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0809877  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2672  hypothetical protein  28.63 
 
 
502 aa  90.5  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  35.71 
 
 
419 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2728  hypothetical protein  28.63 
 
 
502 aa  90.5  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
363 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
394 aa  89.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
384 aa  89  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 
384 aa  88.6  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  30.13 
 
 
428 aa  88.2  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.76 
 
 
490 aa  87.4  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.76 
 
 
490 aa  87.4  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
381 aa  87.4  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
357 aa  87  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  30.23 
 
 
486 aa  86.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.46 
 
 
500 aa  86.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  20.87 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.32 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  20.87 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  27.68 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1300  glycosyltransferase  25.74 
 
 
506 aa  84.3  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.24 
 
 
366 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
390 aa  83.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  23.27 
 
 
353 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  30.49 
 
 
365 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.13 
 
 
502 aa  82.4  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
420 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
392 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  29.37 
 
 
369 aa  82  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
392 aa  82  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
356 aa  82  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2882  glycosyl transferase, group 1  23.49 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  29.88 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.54 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.54 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.54 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.54 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  29.88 
 
 
365 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
394 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
371 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
366 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
309 aa  80.1  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
370 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  20.37 
 
 
354 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>