More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0324 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 356 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  84.75 
 
 		 355 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  73.58 
 
 		 350 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  70.66 
 
 		 356 aa  507  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  69.71 
 
 		 357 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  73.18 
 
 		 361 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  71.35 
 
 		 350 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  69.34 
 
 		 354 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  68.84 
 
 		 358 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 		 361 aa  464  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  69.66 
 
 		 361 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  70.29 
 
 		 364 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  67.81 
 
 		 363 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  68.98 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  65.06 
 
 		 367 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  65.91 
 
 		 373 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  63.17 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  62.64 
 
 		 357 aa  444  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  63.71 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  62 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  62.22 
 
 		 357 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  62.22 
 
 		 357 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  62.22 
 
 		 357 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  62.36 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  68.45 
 
 		 362 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  68.73 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  67.26 
 
 		 362 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  62.86 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  64.25 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  65.12 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  62.11 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  67.72 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 		 365 aa  403  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  65.5 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.33 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 355 aa  371  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 355 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 358 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  54.82 
 
 		 378 aa  355  6.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 		 355 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  46.91 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 355 aa  352  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  48.03 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 361 aa  345  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  48.69 
 
 		 355 aa  345  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.58 
 
 		 355 aa  345  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  51.16 
 
 		 355 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  48.61 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 357 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  48.55 
 
 		 355 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 356 aa  341  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  50.3 
 
 		 359 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  48.84 
 
 		 363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 		 359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  47.55 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  46.48 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  48.47 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  46.4 
 
 		 362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 352 aa  335  5e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  47.99 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  45.43 
 
 		 357 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  47.03 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  46.17 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  46.97 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  47.03 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  46.97 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 352 aa  334  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 364 aa  332  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>