57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4450 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  100 
 
 		 350 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01399  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumI  41.19 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.490868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0743  putative glycosyl transferase  42.01 
 
 		 421 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136224  hitchhiker  0.00617937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4490  hypothetical protein  30.41 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  25.25 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  33.33 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  24.79 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  29.11 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  27.33 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1086  hypothetical protein  26.28 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3496  Zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  27.3 
 
 		 503 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  29.87 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 381 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1094  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 365 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  28.35 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  31.05 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  21.09 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 396 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2186  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 823 aa  42.7  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>